2024年3月2日发(作者:深圳前海世茂大厦)

西北植物学报,2021

,4

1

(5.)

=0738

0745Acta

Bot. Boreal.

-Occident.

10. 7606/j.

issn.

1000-4025.

2021.05.

0738http

://xlzwxb.

alljournal.

net玉米转录因子基因ZmMYB308的

克隆及表达分析王新涛杨

青2,代资举3,李保叶郝俊杰1*

(1河南省农业科学院植物保护研究所,郑州450002;河南省农业科学院芝麻研究中心,郑州450002;

3河南省作物分子育种

研究院,郑州450002)摘要:MYB类转录因子广泛地参与了植物生长发育的许多重要过程,在调控木质素合成途径中也起着重要作

用。为探索MYB转录因子在玉米发育中的功能,该研究利用玉米茎秆转录组测序数据,对玉米茎秆发育过程中差

异表达的MYB转录因子进行筛选和分析,在此基础上,通过RT-PCR方法克隆获得了

ZmMYB308基因。结果表

明:()共检测到14个差异表达的MYB转录因子,其中10个下调表达,4个上调表达。(2)ZmMyB308基因包含

一个74

7

Ip的开放阅读框,可编码248个氨基酸,相对分子质量27.01

kl),等电点为9. 17;系统进化树比对表明,

玉米ZmMYB308蛋白和谷子SiMYB308蛋白的亲缘关系较近,相似性高达94%。()实时荧光定量PCR结果显

示,ZmMYB

3

08在玉米不同发育时期和不同组织中的表达差异显著,且ZmMYB

308基因的表达随着玉米茎秆发

育的推进呈先升高后降低的趋势,在吐丝期表达量达到最高,随后在灌浆期显著下降;不同组织定量分析显示,

ZmMYB

308基因在木质素含量高的茎秆和根中高表达。研究推测,ZmMYB

308基因可能在玉米茎秆发育过程中

起着重要作用,该研究结果为进一步探索玉米木质素合成的分子机制奠定了基础。关键词:玉米;MYB转录因子;ZmMYB308;荧光定量PCR中图分类号:Q785;

Q786;

Q789

文献标志码:ACloning

and

Expression

Analysis

of

TranscriptionFactor

Gene

ZmMYB308

in

MaizeWANG

Xintao1

, YANG

Qing2

,

DAI

Ziju3

,

LI

Baoye1

,

HAO

Junjie1*(1

Plant

Protection

Institute,

Henan

Academy

of

Agricultural

Sciences,

Zhengzhou

450002,

China;

2

Sesame

Research

Center,

Henan

Academy

of

Agricultural

Sciences,

Zhengzhou

450002,

China;

3

Henan

Academy

of

Crop

Molecular

Breeding,

Zhengzhou

450002,

China)Abstract:

MYB

transcription

factors

are

widely

involved

in

plant,

growth

and

development.,

and

also

play

an

important

role

in regulating

lignin

synthesis.

In

this

study,

in

order

to

explore

the

role

of

MYB

transcrip?tion

factor in

maize

development.,

the

differentially

expressed

MYB

transcription

factor

genes

were

screened

and

analyzed

based

on

the

transcriptome

sequencing

data

of

maize

stems?

and

the

ZmMYB308

gene

was

cloned

by

RT-PCR

method.

The

results

showed

that.:

(1

)

a

total

of

1

4

differentially

expressed

MYB

transcription

factor

genes

were

detected

in

different,

periods, among

which

1

0

were down-regulated

and

4

were

up-regulated.

(2)

ZmMYB

308

contains

a

747

bp

open

reading

frame,

which

encodes

a

248

ami?收稿日期=2021-01-29;修改稿收到日期:2021-04-20基金项目:河南省科技攻关计划(6

,);河南省农业科学院科研发展专项(2020CY011.2020YQ33)作者简介:王新涛(1983—)男,博士,助理研究员,主要从事玉米分子遗传育种o

E-mail:

tao-450002@163. com*通信作者:郝俊杰,博士,研究员,主要从事玉米病害研究。E-mail:

ha)jjds@

163.

com

5期王新涛,等:玉米转录因子基因ZmMYB308的克隆及表达分析739no

acids

polypeptide

with

a

protein

molecular

weight,

of

about

27.

01

kD

and

a

theoretical

isoelectric

point,

of

9.

1

7.

Blast,

results

showed

that

ZmMYB308

was

closely

related

to

SiMYB308

of

foxtail

millet,

with

94%

similarity.

(3)

The

results

of

real

time

quantitative

PCR

analysis

showed

that

ZmMYB

308

was

significant?ly

differentially

expressed

in

different,

development,

periods

and

tissues.

The

expression

of

the

ZmMYB308

first,

increased

gradually

and

then

decreased

with

the

development,

of

maize

stem,

and

reached

the

peak

at

the

silking

stage.

Meanwhile,

ZmMYB308

was

highly

expressed

in

maize

stems

and

roots

which

had

lignin

ultsindicatedthat

ZmMYB308

mightplayanimportantroleintheregulationofstem

worklaysthefoundationforfurtherexploringthe

molecularregulatory

mechanism

ofligninsynthesisin

words:

maize;MYBtranscriptionfactor;ZmMYB308;RT-PCR玉米是中国最重要的粮食作物之一,近年来玉

米生产规模化程度提高,对于玉米品种适应全程机

械化的要求也越来越迫切,而玉米茎秆倒伏是制约

中国玉米机械化收获发展的主要因素之一;同时

随着全球极端气候发生频率的不断增多,对于玉米

品种的稳产抗倒性要求也越来越高。研究表明,全

世界每年因倒伏引起的玉米产量损失估计达到5%

~20%,倒伏不仅严重影响玉米产量而且制约着玉

米机械化收获程度的提高[4]。木质素是构成次生

细胞壁的主要成分之一,适当提高木质素含量可以

增强玉米茎秆抗折力,从而降低倒伏引起的

损失[6]。MYB

转录因子作

物中

的转

族之一,广泛地参与调节了植物生长发育的许多重

要过程,如调控基因转录、维持细胞结构、信号通路

传导和生物及非生物胁迫的生理响应等[]。MYB

类蛋白的N端通常含有约51~52个氨基酸组成的

高度保守的MYB结构域,C端为转录激活结构域;

根据所含MYB结构域的数量和位置,MYB转录因

子可分为

1R-MYB.

R2R3-MYB.

3R-MYB

4R-

MYB四

个亚类:1R-MYB又

被称为

MYB-related

亚类,只包含一个R结构域,在维持细胞完整性和

周期节律方面发挥着重要作用;R2R3-MYB是数量

最多的亚类,广泛参与植物的生长发育和代谢途径

调节等过程;3R-MYB亚类在植物中的数量相对较

少,它们主要是参与细胞周期运行以及细胞分化;

4R-MYB亚类在MYB转录因子基因家族中是最小

的一类,对其功能的研究目前还很少[]。通过苯丙烷途径合成的木质素是构成植物骨架

的主要成分之一,多个MYB转录因子在木质素合

成途径中起着重要的调节作用[]。拟南芥中次生细

胞壁相关蛋白AtSND1通过调控下游的AtMYB83

AtMYB

46,进而诱导

AtMYB

58

AtMYB

63

AtMYB85的表达,最终引起相关木质素合成基因

上调[1<-11];桉树MYB2蛋白通过直接与苯丙烷途径

中CCR和CAD基因的启动子结合,从而影响木质

素和次生壁的形成[12];水稻OsMYB46在拟南芥中

过表达可以激活次生壁的合成途径[3]。这些不同

的MYB成员通过正向或负向作用机制有效调控木

质素的合成,因此,加强对MYB家族基因的相关研

究具有重要的现实意义。玉米MYB转录因子在茎秆中参与木质素生物

合成的研究相对较少,对ZmMYB308基因的研究

还未见报道。本研究利用玉米自交系\'郑58,不同

发育阶段的茎秆转录组数据,初步筛选出差异表达

的MYB转录因子并进行分析,以\'郑58,茎秆为材

料,克隆了玉米ZmMYB

308基因,对该基因进行了

生物信息学特征分析,利用荧光定量PCR分析Zm?MYB

308

在玉米不同部位与不同发育时期的表达

模式,以期为玉米高茎秆强度基因筛选及分子育种

应用提供依据。1材料和方法1.

1

材料以玉米优良自交系\'郑58,为材料[14],种植行长

2

m,行距0.6

m,株距0.25

m。2018年6月在河南

省农业科学院原阳基地播种,出苗后正常田间管理,

分别取6叶期、拔节期、大喇叭口期、吐丝期和灌浆

期(吐丝后10

d)的玉米茎秆,在玉米吐丝期取茎、

根、叶、花丝、雄穗和雌穗等不同组织为样品,经液氮

速冻后于一80

C超低温冰箱保存备用,每个样品3

个生物学重复。1.2

方法1.2.1茎秆穿刺强度测定在玉米吐丝期和灌浆

期进行茎秆穿刺强度测定,利用YYD-型数显植物

茎秆强度测定仪(浙江托普仪器有限公司)选择地上

部第3节间中部,对玉米茎秆进行穿刺,瞬间读取并

记录数据(N/mm2),每个时期连续选取5株进行

740西北植物学报41卷测定。蛋白序列保守结构域分析;利用cNLS

Mapper

(ht?tp

//

nls-mapper.

iab.

/)分析基因核定位

1.2.2转录组测序及差异表达基因筛选根据\'郑

58,茎秆强度变化,选择其具有显著差异时期(抽雄

信号肽;使用

ExPAsy

Compute

pI/MW(http

://

www.

expasy.

org/tools/pi_tool.

html)工具计算蛋

期和灌浆期)的茎秆(地上部第3节间)进行采样,采

集的样品(3次生物学重复)送至北京诺禾致源科技

白序列的分子量及等电点;利用DNAMAN9软件

进行蛋白翻译和序列比对。股份有限公司进行转录组测序和分析。分别提取各样品总RNA并检测合格后,依次

进行Oligo(dT)磁珠富集、mRNA反转录、cDNA

1.2.6荧光定量PCR表达分析

根据转录组筛选

获得的差异候选基因序列设计荧光定量引物,玉米

肌动蛋白基因(..p-Actin)为内参基因(表1)。以玉米

文库构建和Illumina平台测序,参考玉米B73(Ref-

Gen_v4)基因组序列,进行序列组装、比对和功能注

不同部位和不同时期的茎秆cDNA为模板,反应体

系为15

“L,其中cDNA模板1

yL,上下游引物各

0.

6

“L、SYBR

Premix

Ex

Tag

(TaKaRa)

7.

5

“L、

ddH2

O

5.

3

yL。在荧光定量

PCR

仪(Bio-Rad

M-

释等相关分析。基因表达量采用FPKM

(

frag?ments

per kilobase

of

exon

model

per

million

mapped

reads)计算[15],利用DEseq分析差异基因,

以差异倍数

log2

(Fold change)

>1且错误检出率

(FDR)<0.05为标准筛选吐丝期和灌浆期茎秆中

niopticon

Real-Time

PCR System)

上进行扩增,

量PCR程序:95

C预变性2 min,95

C变性10

s,58

C退火30

s,72

C延伸25

s,并收集荧光信号,40个

差异表达的

MYB

转录因子基因。1.2.3玉米RNA提取及cDNA第1链合成

各样

品经液氮研磨后利用TRNzol法提取总RNA,1%

琼脂糖凝胶电泳检测RNA完整性。以不同玉米样

循环。基因的相对表达量釆用2

2CT算法进行

分析。品总

RNA

为模板,使用

PrimeScript

RT-PCR

Kit

(TaKaRa)试剂盒,反转录获得玉米cDNA第一链。2结果与分析2.1差异表达MYB转录因子的筛选及分析\'郑58,在吐丝期的茎秆穿刺强度为25.

87

N/

mm2,在灌浆期的茎秆穿刺强度为30.

23

N/mm2。

1.2.4

玉米ZmMYB308基因的克隆根据转录

组筛选的差异表达候选基因及在NCBI上比对筛

选,在GenBank中获得一条具有完整开放阅读框

(open

reading

frame,

ORF)的玉米

MYB308

序列,

对吐丝期与灌浆期的茎秆MYB转录因子基因数目

进行统计分析(表2),获得14个差异表达MYB转

录因子基因,分别位于玉米的1、2、3、5、6、7、8和10

染色体,其中10个表达量下降,4个表达量上升。

利用Primer

Premier

5.

0软件设计用于扩增Zm?MYB

308

特异弓I

ZmMY

B308-F (

TCTTC-

CGTTTCCGTCTCCC)和

ZmMYB

308-R(CG

ACG-

ACGCCTGCCTTAT)。以\'郑

58,茎秆

cDNA

为模

荧光定量PCR分析结果(图1,部分结果)显示,

MYB

3

9/MYB

5

9

(下调)和

MYB

4/MYB12

6

(上调)

板进行全长扩增。在吐丝期和灌浆期茎秆中的表达趋势与转录组数据

1.2.5

生物信息学分析

利用NCBI的ORFfind-

er

(htps:///orfinder/)

分析结果趋势相符,验证了转录组基因表达数据的

可靠性。工具预测基因

ORF

区、CCD

(

https

://www.

ncbi.

/Structure/cdd/)

根据SANT保守结构域的数目进行分类,这些

工具进行

差异表达的MYB转录因子包含2个1R-MYB和12表1荧光定量PCR分析的候选基因及其引物序列T\'ablc

1

Candidate

gene

and

primer

sequences

used

for

qRT-PCR基因名称Gene

name

正向引物Forward

primer反向引物

Reverse

primerMYB

4

GTGCTGCGAGAAGATGGGAGCAGCAGCAGGAGGAAGAAGCGTCGTCCGTGACTACCAAGAGCGGGCTGAAGAAAGGGCGTGGAGGCTGATGATGGCCGTGACAGCATCGGAAGTGCCGCGATGTCGTTCCAMYB

12

6

MYB59

MYB39

MYB3080-ActinCGGATGTGCGTGTTCCAGTAGCGCTGGTCCTCTTCCTTGGTTTCTTCCGTTTCCGTCTCCCCCCTGAGGTTCTATTCCAGCCCCAGGGAACATAGTGGAGCC

5期王新涛,等:玉米转录因子基因ZmMYB308的克隆及表达分析表2差异表达MYB转录因子基因信息741Table

2

The

information

of

differentially

expressed

MYB

transcription

factor

genes基因名称GenenamePutative

MYB

基因IDGeneIDGRMZM5G887276GRMZM2G048295分子量Molecular

weight/kD等电点

pI8.73染色体Chrlog2

(灌浆期vs吐丝)

Grain

filling

stage

vs

Silking

stage转录因子分类

Type46.20128—2.14—2.50—2.981R-MYBR2R3-MYBR2R3-MYBR2R3-MYBR2R3-MYBR2R3-MYBR2R3-MYBR2R3-MYBR2R3-MYBR2R3-MYBMYB4MYB308MYB3031.7827.0147.0136.945.429.175.966.558.43GRMZM2G405094GRMZM2G171781GRMZM2G—1.86—3.18—7.84下调表达Down-regulatedexpressionMYB46MYB126GRMZM2G001223GRMZM2G077789GRMZM2G05125635.5827.93MYB859.154.58—2.99—4.65—4.128—2.671.

321.

53MYB-IF35MYB1538.583Zm00001d025864Zm00001d014701GRMZM2G30585630.266.466.041056MYB-PHL6MYB5950.127.937.0561R-MYBR2R3-MYBR2R3-MYBR2R3-MYB上调表达Up-regulatedexpressionMYB22MYB39GRMZM2G096358GRMZM2G031323GRMZM2G00906039.2240.8940.23876.572.451.49MYB21□吐丝期

Silking

stage

■灌浆期

Grain

filling

stageM

1*坦浪友

UA吳?口

图1玉米吐丝期和灌浆期MYB部分基因的相对表达Different

normal

letters

represent

significant个R2R3-MYB亚类,没有发现3R-MYB和4R-

MYB。对蛋白序列分析发现,茎秆差异表达的

MYB蛋白家族分子量在27.

01?50.

lkD之间,等

电点为4.

58?9.17。这些结果说明随着玉米茎秆

的生长发育,各MYB转录因子的表达出现差异化。2.

2

玉米ZmMYB308基因cDNA的克隆根据以上转录组差异基因分析数据,再结合其

他植物MYB308类基因在茎秆木质素合成途径中

的负调控作用模式[16-17],选取在吐丝期和灌浆期显RAE

UOISSUJdxuEREM.

DL5000;1.

cDNA图2

ZmMYB

308基因cDNA扩增不同小写字母代表0.

05水平差异显著Fig.

2

PCR

product

of

ZmMYB308

cDNA著下调表达的玉米MYB

308基因进行后续试验分

differences

at

0. 05

level析。以玉米自交系\'郑58,的茎秆cDNA为模板,经

PCR扩增获得玉米ZmMYB

30的cDNA序列(图

2)其

cDNA

全长

907

bp,包含一个

747

bp

ORF,

Fig.

1

Relative

expression

of

some

MYB

genesin

the

silking

stage

and

grain

filling

stage编码248个氨基酸。通过MaizeGDB数据库Blast序

列分析发现ZmMYB308基因位于玉米第8染色体

的bin8.

08区域,包含2个外显子和1个内含子。2.3

玉米ZmMYB308基因的生物信息学分析经

ExpasyProtParam

预测

ZmMYB308

蛋白分

27.01

kD,

9.17,

G179H1874N354O349S13,不稳定系数为61.

67,蛋白疏

水性指数为一0.533,脂肪系数为69.8,说明该蛋白

为不稳定的亲水性蛋白。利用cNLS

Mapper预测

在蛋白N端有一段核定位信号(图3)通过NCBI

742西北植物学报41卷SANT结构域,Myb

DNA-binding结构域,REB1超家族

图4

ZmMYB308蛋白功能性位点分析SANT

domain,

Myb

DNA-binding

domain,

REB1

superfamilyFig.

4

Conserved

domain

analysis

of

ZmMYB308

proteinio2030

40 50

60ATGGGCAGGTCCCCGTGCTGCGAGAAGGCGCACACGAACAAGGGCGCGTGGACCAAGGAA

M

G

R

S

P

C

C

E

K

A

H

T

N

K

GAW

T

K

E70 80

90 100 110

120GAGGACCAGCGCCTGATCGCCTACATCAAGGCGCACGGCGAGGGGTGCTGGCGCTCGCTG

E

D

Q

R

L

I

A

Y

I

K

A

H

G

E

G

C

W

R

S L

130

140 150 160 170

180CCCAAGGCCGCCGGCCTCCTCCGCTGCGGCAAGAGCTGCCGGCTTCGCTGGATGAAC1AC

P

K

A

A

G

L

L

R

C

G

K

S

CRLRWMNY

190

200

210

220 230 240CTCCGCCCGGACCTCAAGCGCGGCAACTTCACGGACGACGACGACGAGGTCATCATCAAG250

260 270

280 290 300CTCCACGCCCTGCTCGGCAACAAGTGGTCGCTCAFCGCGGG6CAGCTGCCGGG6CGGACG

L

H

A

L

LGNKWS

L

I

A

GQ

L

P

G R T310

320

330

340

350 360GACAACGAGATCAAGAACTACTGGAACACGCACATCAAGCGCAAGCTGCTGACCCGCGGCD

N

E

I

KN

Y

W

N

T

H

I

K

R

K

L

L

T R

G370

380

390

400

410

420ATCGACCCGCAGACGCACCGCCCGCTGAGCGCCGCCGCCGCCCTCACCGCCGGCTTCCCGI

D

P

Q

T

H R

P

L

S

A

A

A

A

L

T

A

G

F

P430

440

450

460

470

480TCGCCCGCGCGCCCGCCCACCGTGCTGTTCGCGCGCCCGGCGCCGTCGGAGGACGGCGGCS

P

A

R

P

P

T

V

L

F

ARP

A

P

S

E

D

G

G490

500 510

520 530 540CACATCAGCGGCGGCGGGAGCGCGGACGCGCCGCGGTGCCCCGACCTCAACCTGGACCTG

H

IS

GGG

S

ADA

PRC

PDLNL

DL550

560 570 580

590 600TCCGTGGGCCCGCCGTGCTCGCCGCCCAAGACGCCGGCGGCCACCGCGTCGACGCCCACGS

V

G

P

PCS

P

P

K

T

P

A

A

T

A

S T

P

T610

620

630

640

650 660TCGCAGCAGCAGCAGCGGACGACGACCATCTGCCTGTGCTACCACCTCGGCGTCCGCAGC

S

Q

QQQ

R

T

T

T

I

C

L

C

Y

H

L

G

V

R

S670

680

690

700

710 720GGGGAGGCCTGTAGCTGCXKAGTCCCCCrCGCCAGC6GCG6CGGGGTTCCGGTTTCTCCGGG

E

A

C

S

C

K

S

P

SPA

A

A

G

FRF

L

R730

740CCGCTCGAGGAGGACCAGTACATATAARLE

E

D

Q

Y

I

*桜树

Eucalyptus

grandis

白梨 Pyrus

x

bretschneideri

苹果

Malus

domestica桑树

Morus

notab

ilis6813可可

Theobroma

cacao

陆地棉

Gossypium

hirsutum

芝麻

Sesamum

indicum二穗短柄草

Brachypodium

distachyon

节节麦

Aegilops

tauschii

421141481161野生二粒<1、麦

Triticum

dicoccoides水稻

Oryza

sativa

541181601201谷子

Setaria

italica

玉米

Zea

mays

高粱

Sorghum

bicol

or

狗尾草

Setaria

viridis661221721241图5不同物种间MYB308蛋白的进化树下划线为核定位信号图3

ZmMYB308基因开放阅读框及预测氨基酸序列

The nuclear

localization

signal

is

underlinedFig.

5

Phylogenetic

tree

of

MYB308

protein

homologues

from

different

speciesFig.

3

ORF

of

ZmMYB

308

gene

and

predicted2.5

玉米ZmMYB308基因的表达分析为揭示玉米不同发育时期在茎秆中Zm?MYB

308基因的表达特性,分别对\'郑58,不同发育

amino

acid

sequence分析CDD功能结构域发现ZmMYB308蛋白N端

具有2个保守的DNA结合结构域(图4),属于典型

的R2R3-MYB亚类转录因子。时期茎秆中该基因的表达进行分析,结果(图6)表

明ZmMYB

308随着玉米发育的推进呈先升高后

2.4

ZmMYB308同源及进化分析利用NCBI数据库的BlastP在线检索筛选其

他植物的MYB308蛋白序列,选取了桉树(XP_

010090332.

1)、白杨(XP_009376958.

1)和二穗短柄

降低的趋势,在吐丝期表达量最高,随后在灌浆期下

降,其变化趋势与茎秆转录组测序结果趋势一致。为了揭示ZmMYB

308在玉米不同组织中的表

达情况,在玉米吐丝期对不同组织进行实时荧光定

量分析,结果(图7)表明ZmMYB

30在玉米不同组

草(XP_003564745.

1)等共14个同源序列,通过

DNAMAN9.

0将玉米ZmMYB308与其他植物的

织中均有表达,在玉米茎秆中的表达量最高,根、雌

穗、雄穗、叶片中的表达量次之,花丝中的表达量最

MYB308蛋白序列对比,建立了一个无根分子系统

低,其茎秆中的表达量约为花丝中的7. 5倍。进化树(图5)。比对显示MYB308类蛋白序列在N

端高度保守,而C端的序列保守性较低,系统进化分析将15个不同植物的MYB308蛋白划分为2

3讨论随着转录组测序技术的不断进步,在基因水平

组,其中ZmMYB308与谷子、高梁和二穗短柄草等

MYB308蛋白聚为一类,且与谷子的相似性最高,

上对整体转录活动进行实时检测,从而完整分析不

同的代谢通路和验证基因功能变得越来越高效快

捷[8「19]。近年来,人们在拟南芥、水稻和玉米等多种达到94%。

5期王新涛,等:玉米转录因子基因ZmMYB308的克隆及表达分析743与了木质素的生物合成途径[10];在杨树中,过量表

*WAUI

PtrMYB

20

PtrMYB

21

坦浪友

UA吳?

UOISSUJdxu基因可以引起次生壁的异位沉积,导致次生壁增

厚[3]。也有多个2R-MYB亚类转录因子是负向调

控木质素合成的:在拟南芥中过表达玉米Zm?MYB

31

ZmMYB

42

基因可以抑制木质素合成途径

ERE6叶时期拔节时期大喇叭口期吐丝期

灌浆期6-leaf

stage

Jointing

Large

trumpet

Silking

Grain filling

stage

stage

stage

stage

中的多个基因,从而降低组织中的木质素含

量[24_25];银合欢LMYB1过表达抑制了苯丙烷途径

基因的表达水平,从而引起木质素含量的降低[6];

发育时期

Developmental

stage不同小写字母代表0.

05水平差异显著图6

ZmMYB308在玉米不同发育时期的表达Different

normal

letters

represent

significantdifferences

at

0.

05

levelFig.

6

The

expression

pattern

of

ZmMYB

308in

different

development

stages8aR7AUI*

6UOI坦S5S浪UJd友xu

吳U?A3口ER2E

0....................................................................................................根

花丝

雌穗

雄穗Root

Stem

Leaf

Silk

Ear Tassel组织

Tissues不同小写字母代表0.

05水平差异显著

图7

ZmMYB30在不同组织的表达Different

normal

letters

represent

significant

differences

at

0.

05

levelFig.

7

Relative

abundance

of

ZmMYB

308

transcriptsin

different

tissues植物的不同发育过程进行了大量的转录组分析,从

不同角度解析了目的基因及其调控基因的调控网

络[20~22]

o本研究通过转录组测序和分析,在不同发

育时期的玉米茎秆中鉴定出14个差异表达MYB

转录因子,在此基础上,采用RT-PCR技术克隆了

玉米R2R3-MYB类转录因子ZmMYB30

基因,并

对其生物信息学与时空表达特性进行了分析。2R-MYB亚类作为MYB转录因子的主体,可

以通过激活木质素合成途径的相关基因来实现对木

质素合成的正向调控:在拟南芥中MYB58能够直

接激活木质素生物合成基因CPAL1C4H和4CL1

等)和次生壁相关漆酶基因(LAC4)的表达进而参

金鱼草中AmMYB

308和AmMYB

330共同作用可

降低木质素的积累[6]。本研究通过转录组分析玉

米吐丝期和灌浆期茎秆中MYB转录因子表达量变

化,鉴定出差异表达的MYB转录因子中2R-MYB

亚类占到85.71%,因此推测这些差异表达的MYB

转录因子,特别是2R-MYB亚类转录因子正向或负

向地参与了玉米茎秆木质素的生物合成,进一步克

隆这些玉米的MYB类转录因子,将有助于全面了

解这类基因的功能。作为MYB家族成员的MYB308及其同源基

因在多种作物中被证实能够调控影响木质素合成途

径的相关基因[16-17]

o本研究从玉米中克隆得到

ZmMYB

30基因,生物信息学分析显示Zm-

MYB308蛋白与其他已报道的MYB308类基因的

蛋白保守结构域具有较咼的相似性,在其N端具有

家族典型的MYB保守结构域和核定位信号,玉米

ZmMYB

308转录因子可能在细胞核中与其他基因

互作并调控其下游基因。ZmMYB

30基因在不同

部位是组成型表达的,在茎中表达量最高,并且

ZmMYB

30随着茎秆发育在吐丝期达到峰值后下

降,同PgMYB308基因在石榴中的表达趋势类

似[4]。结合\'郑58,茎秆强度的表型变化,Zm-

MYB308基因可能和金鱼草AmMYB308.石榴

PgMYB

30基因一样在木质素合成过程中起着负

调控作用。研究还发现ZmMYB

31表达受低温诱

导,过表达ZmMYB

31能增强植株对低温胁迫的耐

受性[7],苹果MdMYB

30基因在调控苹果花青苷

合成中起着重要作用:28],小桐子JcMYB

30基因

在根与茎中对低温做出响应[29],紫斑白三叶

TMYB

30参与类黄酮次生代谢生物合成调

控[0],本研究中ZmMYB

30在根、雌穗中的表达量

高于叶片和花丝,暗示了玉米ZmMYB

30

基因可

能还具有其他重要功能和作用机制,需要进一步深

入研究。本研究通过RNA-Seq测序和数据分析发现,

744西

报41卷在获得的玉米茎秆转录组数据中除MYB转录因子

外还存在其他差异表达基因,挖掘和解析这些重要

基因的功能有助于进一步提高对玉米木质素合成机制的认识,也为利用分子生物学手段培育高茎秆强度玉米品种奠定了基础。作者贡献:王新涛和郝俊杰是本研究的实验设计和实验研究的执行人;王新涛和李保叶完成数据分析和论文初稿的写

作;杨青和代资举参与实验设计与实验所得数据分析;郝俊杰是本研究的的构思者及负责人,指导数据分析,论文写作与修

改。全体作者都阅读并同意最终的文本。参考文献:[]房海悦,李毅丹,曲文丽,等.玉米倒伏影响因素及其QTL

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